Как запускать Draw polygons из макросов? Тот, который из TerraScan->Tools->Draw polygons...
В списках доступных действий для макросов его нет.

Да, в общем, никак. Не все функции, доступные в меню и в панелях инструментов, доступны для использования в макросах. Использовать Draw poligons в макросе в качестве keyin тоже не получится, так как нельзя задать в командной строке параметры инструмента.