Если запустить Model keypoint по Fence при выключенном отображении точек, то Model keypoint ничего не сделает.

Это не удивительно. Fence (инструмент MicroStation) - атрибут вида, его действие распространяется на те элементы, которые в данном виде (окне) присутствуют, включены, видимы и т.д. Думаю, в документации Bentley Systems это можно найти.

Но, например, модель строится по Fence при выключенных точках.
А так - логично, конечно.